Autor: Yoshiyuki Sadamoto
Cantidad de tomos: 14
El alma de Shinji ha quedado destrozada a causa de la lucha contra el ángel. La pérdida de Touji le hace replantear seguir en Nerv y se niega a volver a subir al Eva-01. Cuando su decisión ya parece irreversible, la intervención de Kaji resultará esencial. La conversación que mantiene con Shinji nos revela su oscuro pasado y también los auténticos intereses de las organizaciones Nerv y Seele.